Après avoir ciblé l'objectif d'améliorer la respiration du moteur, les concepteurs-projeteurs du Superquadro se sont concentrés sur le défi suivant : réaliser un réglage du moteur susceptible de combiner de manière optimale la distribution à hautes performances et un fonctionnement régulier obtenu en réduisant la dispersion cyclique de la combustion. Pour parvenir à ce résultat, Ducati a introduit un système d'air secondaire qui assure le complètement de l'oxydation des hydrocarbures imbrûlés, en réduisant efficacement les niveaux d'anhydride carbonique et de monoxyde de carbone (CO). Le système est contrôlé par une soupape électronique commandée par la centrale commande moteur et activée en fonction de conditions spécifiques de fonctionnement du moteur. Cette soupape permet d'introduire dans le conduit d'échappement de chaque culasse (dans une position à peine en aval de la soupape d'échappement) un flux d'air propre provenant directement de la boîte à air. Une seconde soupape à clapet, disposée dans la culasse moteur, rend ce flux unidirectionnel. L'introduction contrôlée d'oxygène permet de compléter la combustion des gaz chauds en sortie, en éliminant les éventuelles fractions de carburant imbrûlé susceptibles d'atteindre l'échappement dans certaines conditions.